題目:非編碼RNA功能基因組學技術
主講人:薛愿超教授 中國科學院生物物理研究所
講座時間:2021年5月24日下午03:30
講座地點:生物學院辦公樓108報告廳
主講人簡介:
薛愿超,中國科學院生物物理研究所研究員、中國科學院大學崗位教授、博士生導師。2010年于武漢大學取得博士學位,2010年至2015年在美國加州大學圣地亞哥分校從事博士后研究,2015年5月回國后在中科院生物物理研究所任研究員。長期從事RNA結合蛋白和非編碼RNA研究,重點關注RNA結合蛋白在細胞分化、轉分化及癌變過程中的功能機制,旨在揭示與細胞命運決定相關的關鍵分子事件,為再生醫學研究提供理論基礎和方法技術。自2015年以來,先后獲得了國家自然科學基金委集成項目(首席科學家)、重點項目、創新群體、國家重點研發計劃和中國科學院先導項目的支持。近5年來,圍繞RNA結合蛋白在染色質層面調控轉錄的機制開展了系統性探索,取得了突破性進展,在Nature、Nat Neurosci、Nat Cell Biol、Nat Commun、Cell Res等雜志發表通訊作者或合作研究論文20余篇。
講座主題:
非編碼核酸序列約占人類基因組的98%,它們經廣泛轉錄產生了海量的非編碼RNA。這些非編碼RNA與RNA結合蛋白結合后經分子內配對和級聯折疊形成了復雜的高級結構。高度結構化的非編碼RNA進而通過與其它RNA分子相互作用以調控轉錄、剪接、翻譯等遺傳信息表達的關鍵步驟。與mRNA所攜帶的遺傳密碼不同,非編碼RNA攜帶了大量的結構密碼,其原位高級結構和動態調控功能研究依然是RNA領域的根本性難題。為了解決這些科學難題,我們近期創建了RIC-seq、vRIC-seq和LACE-seq等新技術,可分別用于系統研究非編碼RNA的原位高級結構、作用靶標以及RNA結合蛋白的具體結合位點。在本次報告中,我將與大家分享這些RNA功能基因組學方法的原理、應用及未來發展。